房屋抵押貸款后被人民法院依法查扣，還是要繼續(xù)還款的。因為房屋抵押貸款是你的房貸未還清，法院查封房產尚末處理，所以應繼續(xù)償貨。
要繼續(xù)還。抵押物滅失后，貸款還是要還的。
法律依據：
《中華人民共和國民事訴訟法》第二百四十四條被執(zhí)行人未按執(zhí)行通知履行法律文書確定的義務，人民法院有權查封、扣押、凍結、拍賣、變賣被執(zhí)行人應當履行義務部分的財產。但應當保留被執(zhí)行人及其所扶養(yǎng)家屬的生活必需品。采取前款措施，人民法院應當作出裁定。
借債還錢天經地義。如果抵押房產借債辦理了抵押登記手續(xù)，司法查封房產無效。如果沒有辦理抵押，則查封有效。但是，借款仍需還。